OSIS merupakan kepanjangan dari Organisasi Siswa Intra Sekolah. Organisasi ini berada di tingkat sekolah dan dibentuk di sekolah menengah yaitu SMP dan SMA. Organisasi ini menjadi wadah berkumpulnya para siswa untuk mencapai tujuan tertentu.
Organisasi ini terdiri dari susunan kepanitian yang terdiri dari ketua, wakil ketua, sekretaris, bendahara, kemudian seksi-seksi lainnya. Setiap jabatan di dalam OSIS memiliki tugas masing-masing. Kepengurusan OSIS memiliki masa kerja yang terbatas yaitu selama satu tahun dan akan diperbaharui lagi.
OSIS bertujuan memfasilitasi para siswa untuk menyalurkan aspirasinya, mengekspresikan kreativitasnya, dan berkontribusi untuk hal-hal yang positif. OSIS memiliki tujuan yang positif bagi seluruh siswa di sekolah yang artinya akan memberikan pengaruh positif juga bagi sekolah itu sendiri.
OSIS Organisasi tertinggi di MA Annur, Organisasi yang paling eksis di setiap harinya apalagi ketika ada acara atau event-event di MA Annur , Karna setiap ada acara pasti melibatkan OSIS, di OSIS pun di ajarkan tentang Kepemimpinan, bagaimana menjadi seorang leader yang bertanggung jawab di setiap acaranya
Di sini juga ajarkan menjadi seorang publikspeaking, terbiasa ngomng di depan, dengan banyak program di OSIS tak heran banyak siswa yang suka di OSIS, dan ada juga yang kesel karena ketika ada Raziaan, Tpi itulah tantangan OSIS menjadi Organisasi tertinggi dan harus bisa merangkul Eskul-eskul di bawahnya.
Kepengurusan OSIS MA Annur Setupatok 2019-2020
ketua : Muhammad Saepudin
Wakil : Ermawati Putri
Sekretaris 1 : Wafa Hamadah
Sekretaris 2 : Susi Maryuni
Bendahara 1 : Cici Kumaya
Bendahara 2 : Maryani
Sekbid PAO :
- Iis Nurhasanah
- Risna Nunung
- Carminah
- Ratna Sari
- Nurmi Asih
Sekbid Keagamaan :
- Roihatul Jannah
- Khodijah
- Silviyana Laras Ulfah
- Elsa Triambarwati
- Siti Anjani
- M.Iqbal
- M.Nasikhin Amirudin
Sekbid lingkungan hidup
- M.fahmi
- Abdul hadi
- Kurniasih
- Siti Rohmatunnisa
- Nur Rokhmatilah
- Dewi safitri
- Sumyati
- Siti Ulfatullatifah
- Lia maulida Afifah
sekbid humas
- rodo
- ririn
- rahayu
- nurhalimah
- tiara
- ulfiyah
- susilawati
- nurtika
Seksi Kepatriotan
- Yuani
- Leyang
- Siti Nur Halisah AK
- Sintia Sari
- Ega
- Siti Atilah
- Ahmad Rifa’i
- Kusniati
- Fika Yulianti